Einrichtungen der Abteilung für Strukturbiologie

Einrichtungen der Abteilung für Strukturbiologie

< zurück zu den anderen Projekten

Das Hauptaugenmerk der Abteilung liegt auf der experimentellen Strukturbestimmung von Membranproteinen mittels KryoEM oder Röntgenkristallographie. Die meisten Proteine ​​werden in der Abteilung exprimiert und gereinigt, die für modernste Molekularbiologie, Klonierung und Membranbiochemie (Ultrazentrifugen, Säulenchromatographie, optische Spektroskopie) sowie für das Wachstum von Bakterien-, Hefe- und Säugetierzellen gut ausgestattet ist in der Kultur. Die Abteilung ist ein häufiger Benutzer der Massenspektrometrieplattform, die von der Abteilung für Molekulare Membranbiologie betrieben wird. Für die Membranproteinkristallisation haben wir einen eigenen kleinen Raum mit konstanter Temperatur und einen Moskitokristallisationsroboter. Die Abteilung Strukturbiologie nutzt regelmäßig die Max-Planck-Synchrotron-Strahllinien an der Schweizer Lichtquelle in Villigen (CH) und die neue PETRA-III-Strahllinie an der DESY, Hamburg, für die Röntgendatenerfassung.

Wir haben eine der besten CryoEM-Suiten weltweit aufgebaut, die über drei hochwertige 300-kV-Elektronenmikroskope (JEOL 3200, FEI Polara und FEI Titan Krios) sowie alle erforderlichen Zubehörteile verfügt, darunter drei 120-kV-Elektronenmikroskope für Screening und Raumtemperaturarbeit. Darüber hinaus hat die Abteilung einen Anteil von 37,5% am 300-kV-Titan-Krios-Elektronenmikroskop am Buchmann-Institut auf dem Riedberg-Campus. Alle High-End-EMs sind mit Einzelelektronenzähl-Direktelektronendetektoren für die hochauflösende Bildgebung ausgestattet.

CryoEM ist extrem computerintensiv. Derzeit stehen der Abteilung 900 CPUs und 20 GPUs zur Verfügung, die über ausreichend Speicher für die Bildverarbeitung großer Komplexe verfügen. Dank einer neuen 10-Gbit-Datenleitung haben wir auch schnellen Zugriff auf den massiven Max-Planck-Hydra-Cluster in Garching. Im Jahr 2016 wurde am Institut ein 3,5-PB-Datenspeichersystem installiert, das unsere Anforderungen für die nächsten Jahre erfüllen sollte.

Zur Redakteursansicht