Publikationen des Max-Planck-Institutes für Biophysik

Publikationen des Max-Planck-Institutes für Biophysik

Zeitschriftenartikel (51)

2001
Zeitschriftenartikel
Grell, E.; Schick, E.; Lewitzki, E.: Membrane receptor calorimetry: cardiac glycoside interaction with Na,K-ATPase. Thermochimica Acta 380 (2), S. 245 - 254 (2001)
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Lange, C.; Nett, J. H.; Trumpower, B. L.; Hunte, C.: Specific roles of protein-phospholipid interactions in the yeast cytochrome bc1 complex structure. EMBO Journal 20 (23), S. 6591 - 6600 (2001)
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Warkentin, E.; Mamat, B.; Sordel-Klippert, M.; Wicke, M.; Thauer, R. K.; Iwata, M.; Iwata, S.; Ermler, U.; Shima, S.: Structures of F420H2:NADP+ oxidoreductase with and without its substrates bound. The EMBO Journal 20 (23), S. 6561 - 6569 (2001)
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Kamberaj, H.; Helms, V.: Monte Carlo simulation of biomolecular systems with BIOMCSIM. Computer Physics Communications 141 (3), S. 375 - 402 (2001)
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Ruiz, T.; Kopperschläger, G.; Radermacher, M.: The First Three-Dimensional Structure of Phosphofructokinase from Saccharomyces cerevisiae Determined by Electron Microscopy of Single Particles. Journal of Structural Biology 136 (3), S. 167 - 180 (2001)
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Ganea, C.; Pourcher, T.; Leblanc, G.; Fendler, K.: Evidence for Intraprotein Charge Transfer during the Transport Activity of the Melibiose Permease from Escherichia Coli. Biochemistry 40 (45), S. 13744 - 13752 (2001)
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Kappl, M.; Nagel, G.; Fendler, K.: Voltage and Ca2+ Dependence of Pre–Steady-State Currents of the Na-Ca Exchanger Generated by Ca2+ Concentration Jumps. Biophysical Journal 81 (5), S. 2628 - 2638 (2001)
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Lill, M. A.; Helms, V.: Reaction rates for proton transfer over small barriers and connection to transition state theory. The Journal of Chemical Physics 115 (17), S. 7985 - 7992 (2001)
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Lill, M. A.; Helms, V.: Molecular dynamics simulation of proton transport with quantum mechanically derived proton hopping rates (Q-HOP MD). The Journal of Chemical Physics 115 (17), S. 7993 - 8005 (2001)
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Bamberg, E.; Clarke, R.; Fendler, K.: Electrogenic properties of the Na+,K+-ATPase probed by presteady state and relaxation studies. Journal of Bioenergetics and Biomembranes 33 (5), S. 401 - 405 (2001)
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Geibel, S.; Friedrich, T.; Ormos, P.; Wood, P. G.; Nagel, G.; Bamberg, E.: The Voltage Dependent Proton Pumping in Bacteriorhodopsin Is Characterized by Optoelectric Behavior. Biophysical Journal 81 (4), S. 2059-2068 (2001)
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Lüpfert, C.; Grell, E.; Pintschovius, V.; Appel, H.-J.; Cornelius, F.; Clarke, R. J.: Rate Limitation of the Na+,K+-ATPase Pump Cycle. Biophysical Journal 81 (4), S. 2069 - 2081 (2001)
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Unger, D.; Barth, A.; Haase, W.; Kauntzinger, A.; Lewitzki, E.; Ruiz, T.; Reiländer, H.; Michel, H.: Analysis of a putative voltage-gated prokaryotic potassium channel. European Journal of Biochemistry 268 (20), S. 5386 - 5396 (2001)
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Bartoschek, S.; Johansson, M.; Geierstanger, B. H.; Okun, j. G.; Lancaster, C. R. D.; Humpfer, E.; Yu, L.; Yu, C.-A.; Griesinger, C.; Brandt, U.: Three molecules of ubiquinone bind specifically to mitochondrial cytochrome bc1 complex. The Journal of Biological Chemistry 276 (38), S. 35231 - 35234 (2001)
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Lee, S. Y.; Hunte, C.; Malaney, S.; Robinson, B. H.: The N-terminus of the Qcr7 protein of the cytochrome bc1 complex in S. cerevisiae may be involved in facilitating stability of the subcomplex with the Qcr8 Protein and Cytochrome b. Archives of Biochemistry and Biophysics 393 (2), S. 215 - 221 (2001)
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Arndt, P.; Volk, C.; Gorboulev, V.; Budiman, T.; Popp, C.; Ulzheimer-Teubner, I.; Akhundova, A.; Koppatz, S.; Bamberg, E.; Nagel, G. et al.; Koepsell, H.: Interaction of cations, anions, and weak base quinine with rat renal transporter rOCT2 compared with rOCT1. American Journal of Physiology-Renal Physiology 281 (3), S. F454 - F468 (2001)
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Hunte, C.: Insights from the structure of the yeast cytochrome bc1 complex: crystallization of membrane proteins with antibody fragments. FEBS Letters 504 (3), S. 126 - 132 (2001)
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Lancaster, C. R. D.: Succinate:quinone oxidoreductases – what can we learn from Wolinella succinogenes quinol:fumarate reductase. FEBS Letters 504 (3), S. 133 - 141 (2001)
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Kannt, A.; Ostermann, T.; Müller, H.; Ruitenberg, M.: Zn2+ binding to the cytoplasmic side of Paracoccus denitrificans cytochrome c oxidase selectively uncouples electron transfer and proton translocation. FEBS Letters 503 (2-3), S. 142 - 146 (2001)
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Watzke, N.; Grewer, C.: The anion conductance of the glutamate transporter EAAC1 depends on the direction of glutamate transport. FEBS Letters 503 (2-3), S. 121 - 125 (2001)
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Vasilets, L.A.; Darmer, D.; Isenberg, G.; Schwarz, W.: RNA from heart of young and old rats leads to the expression of protein(s) in Xenopus oocytes that alter the transport activity of rat Na+,K+-ATPases differently. Pflügers Archiv: European Journal of Physiology 443 (1), S. 84 - 91 (2001)
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Bombarda, E.; Morellet, N.; Cherradi, H.; Spiess, B.; Bouaziz, S.; Grell, E.; Roques, B. P.; Mély, Y.: Determination of the pKa of the four Zn2+-coordinating residues of the distal finger motif of the HIV-1 nucleocapsid protein: Consequences on the binding of Zn2+. Journal of Molecular Biology (London) 310 (3), S. 659 - 672 (2001)
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Radermacher, M.; Ruiz, T.; Wieczorek, H.; Grüber, G.: The Structure of the V1-ATPase Determined by Three-Dimensional Electron Microscopy of Single Particles. Journal of Structural Biology 135 (1), S. 26 - 37 (2001)
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Kühlbrandt, W.: Chlorophylls galore. Nature 411 (6840), S. 897 - 899 (2001)
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Schmid, V. H.R.; Thomé, P.; Rühle, W.; Paulsen, H.; Kühlbrandt, W.; Rogl, H.: Chlorophyll b is involved in long-wavelength spectral properties of light-harvesting complexes LHC I and LHC II. FEBS Letters 499 (1-2), S. 27 - 31 (2001)
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Buet, P.; Gersch, B.; Grell, E.: Spectral Properties, Cation Selectivity, and Dynamic Efficiency of Fluorescent Alkali Ion Indicators in Aqueous Solution Around Neutral pH. Journal of Fluorescence 11 (2), S. 79 - 87 (2001)
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Jahn, T.; Dietrich, J.; Andersen, B.; Leidvik, B.; Otter, C.; Briving, C.; Kühlbrandt, W.; Palmgren, M. G.: Large scale expression, purification and 2D crystallization of recombinant plant plasma membrane H+-ATPase. Journal of Molecular Biology (London) 309 (2), S. 465 - 476 (2001)
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Scharff, E. I.; Koepke, J.; Fritzsch, G.; Lücke, C.; Rüterjahns, H.: Crystal structure of diisopropylfluorophosphatase from Loligo vulgaris. Structure 9 (6), S. 493 - 502 (2001)
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Watzke, N.; Bamberg, E.; Grewer, C.: Early Intermediates in the Transport Cycle of the Neuronal Excitatory Amino Acid Carrier EAAC1. Journal of General Physiology 117 (6), S. 547 - 562 (2001)
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Zachariae, U.; Lancaster, C. R. D.: Proton uptake associated with the reduction of the primary quinone QA influences the binding site of the secondary quinone QB in Rhodopseudomonas viridis photosynthetic reaction centers. Biochimica et Biophysica Acta, Bioenergetics 1505 (2-3), S. 280 - 290 (2001)
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Grabarse, W.; Mahlert, F.; Duin, E. C.; Goubeaud, M.; Shima, S.; Thauer, R. K.; Lamzin, V.; Ermler, U.: On the mechanism of biological methane formation: structural evidence for conformational changes in methyl-coenzyme M reductase upon substrate binding. Journal of Molecular Biology (London) 309 (1), S. 315 - 330 (2001)
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Collinson, I.; Breyton, C.; Duong, F.; Tziatzios, C.; Schubert, D.; Or, E.; Rapoport, T.; Kühlbrandt, W.: Projection structure and oligomeric properties of a bacterial core protein translocase. The EMBO Journal 20 (10), S. 2462 - 2471 (2001)
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Pusch, M.; Ferrera, L.; Friedrich, T.: Two open states and rate-limiting gating steps revealed by intracellular Na+ block of human KCNQ1 and KCNQ1/KCNE1 K+ channels. Journal of Physiology 533 (1), S. 135 - 143 (2001)
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Lebeau, L.; Lach, F.; Vénien-Bryan, C.; Renault, A.; Dietrich, J.; Jahn, T.; Palmgren, M. G.; Kühlbrandt, W.; Mioskowski, C.: Two-dimensional crystallization of a membrane protein on a detergent-resistant lipid monolayer. Journal of Molecular Biology (London) 308 (4), S. 639 - 647 (2001)
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Padan , E.; Venturi, M.; Gerchman, Y.; Dover, N.: Na+/H+ antiporters. Biochimica et Biophysica Acta, Bioenergetics 1505 (1), S. 144 - 157 (2001)
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Kuglstatter, A.; Ermler, U.; Michel, H.; Baciou, L.; Fritzsch, G.: X-ray Structure Analyses of Photosynthetic Reaction Center Variants from Rhodobacter sphaeroides:  Structural Changes Induced by Point Mutations at Position L209 Modulate Electron and Proton Transfer. Biochemistry 40 (14), S. 4253 - 4260 (2001)
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Rousselet, A.; Euteneuer, U.; Bordes, N.; Ruiz, T.; Hui Bon Hua , G.; Bornens, M.: Structural and functional effects of hydrostatic pressure on centrosomes from vertebrate cells. Cell Motility and the Cytoskeleton 48, S. 262 - 276 (2001)
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Yoo, H.-Y.; Boatz, J. A.; Helms, V.; McCammon, J. A.; Langhoff, P. W.: Chromophore Protonation States and the Proton Shuttle Mechanism in Green Fluorescent Protein:  Inferences Drawn from ab Initio Theoretical Studies of Chemical Structures and Vibrational Spectra. The Journal of Physical Chemistry B 105 (14), S. 2850 - 2857 (2001)
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Bárcena, M.; Ruiz, T.; Luis Enrique, L. E.; Brown, S. E.; Dixon, N. E.; Radermacher, M.; Carazo, J. M.: The DnaB·DnaC complex: a structure based on dimers assembled around an occluded channel. The EMBO Journal 20 (6), S. 1462 - 1468 (2001)
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Buet, P.; Lewitzki, E.; Grell, E.; Albrecht-Gary, A.-M.; Wannowius, K. J.; Mass, F.; Elias, H.; Mundt, A.A.; Dupont, Y.: Concentration Jump Experiments for the Precise Determination of Rate Constants of Reverse Reactions in the Millisecond Time Range. Analytical Chemistry 73 (5), S. 857 - 863 (2001)
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Gerchman, Y.; Rimon, A.; Venturi, M.; Padan, E.: Oligomerization of NhaA, the Na+/H+ Antiporter of Escherichia coli in the Membrane and Its Functional and Structural Consequences. Biochemistry 40 (11), S. 3403 - 3412 (2001)
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Lancaster, C. R. D.; Groß, R.; Simon, J.: A third crystal form of Wolinella succinogenes quinol:fumarate reductase reveals domain closure at the site of fumarate reduction. European Journal of Biochemistry 268 (6), S. 1820 - 1827 (2001)
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Nagel, G.; Szellas, T.; Riordan, J. R.; Friedrich, T.; Hartung, K.: Non-specific activation of the epithelial sodium channel by the CFTR chloride channel. EMBO Reports 2 (3), S. 249 - 254 (2001)
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Schmies, G.; Engelhard, M.; Wood, P. G.; Nagel, G.; Bamberg, E.: Electrophysiological characterization of specific interactions between bacterial sensory rhodopsins and their transducers. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 98 (4), S. 1555 - 1559 (2001)
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Lill, M. A.; Helms, V.: Compact parameter set for fast estimation of proton transfer rates. The Journal of Chemical Physics 114 (3), S. 1125 - 1132 (2001)
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Behlau, M.; Mills, D. J.; Quader, H.; Kühlbrandt, W.; Vonck, J.: Projection structure of the monomeric porin OmpG at 6 å resolution. Journal of Molecular Biology (London) 305 (1), S. 71 - 77 (2001)
Zeitschriftenartikel
Bartoschek, S.; Buurman, G.; Thauer, R. K.; Geierstanger, B. H.; Weyrauch, J. P.; Griesinger, C.; Nilges, M.; Hutter, M. C.; Helms, V.: Re‐Face Stereospecificity of Methylenetetrahydromethanopterin and Methylenetetrahydrofolate Dehydrogenases is Predetermined by Intrinsic Properties of the Substrate. ChemBioChem: A European Journal of Chemical Biology 2, S. 530 - 541 (2001)
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Grewer, C.; Mobarekeh, S. A. M.; Watzke, N.; Rauen, T.; Schaper, K.: Substrate Translocation Kinetics of Excitatory Amino Acid Carrier 1 Probed with Laser-Pulse Photolysis of a New Photolabile Precursor of d-Aspartic Acid. Biochemistry 40 (1), S. 232 - 240 (2001)
Zeitschriftenartikel
Grimaldi, S.; MacMillan, F.; Ostermann, T.; Ludwig, B.; Michel, H.; Prisner, T.: QH*- Ubisemiquinone Radical in the bo3-Type Ubiquinol Oxidase Studied by Pulsed Electron Paramagnetic Resonance and Hyperfine Sublevel Correlation Spectroscopy. Biochemistry 40 (4), S. 1037 - 1043 (2001)
Zeitschriftenartikel
Scharff, E. I.; Lücke, C.; Fritzsch, G.; Koepke, J.; Hartleib, J.; Dierl, S.; Rüterjans, H.: Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of DFPase from Loligo vulgaris. Acta Crystallographica Section D-Biological Crystallography 57 (1), S. 148 - 149 (2001)
Zeitschriftenartikel
Schiller, H.; Molsberger, E.; Janssen , P.; Michel, H.; Reiländer, H.: Solubilization and purification of the human ETB endothelin receptor produced by high-level fermentation in Pichia pastoris. Receptors and Channels 7 (6), S. 453 - 469 (2001)

Hochschulschrift - Doktorarbeit (6)

2001
Hochschulschrift - Doktorarbeit
Burzik, C.: Die Ladungstranslokation der F1F0-ATP-Synthase aus Illyobacter tartaricus. Dissertation, 92 S., Fachbereich Biochemie, Pharmazie, Lebensmittelchemie, Johann Wolfgang Goethe-Universität, Frankfurt am Main (2001)
Hochschulschrift - Doktorarbeit
Dietrich, J.: Biochemische und elektronenkristallographische Untersuchungen an Membranproteinen. Dissertation, 102 S., Chemische und Pharmazeutische Wissenschaften, Johann Wolfgang Goethe-Universität, Frankfurt am Main (2001)
Hochschulschrift - Doktorarbeit
Ivanovic, A.: Klonierung rekombinanter Histamin H1-Rezeptoren und deren Charakterisierung, Solubilisierung und Reinigung nach heterologer Produktion. Dissertation, 149 S., Fachbereich chemische und pharmazeutische Wissenschaften, Johann Wolfgang Goethe-Universität, Frankfurt am Main (2001)
Hochschulschrift - Doktorarbeit
Müller, M. F. H.: Vektorieller Ionentransport durch heterolog produzierte Membranproteine thermophiler, methanogener Archaea. Dissertation, 214 S., Fachbereich Chemie, Johann Wolfgang Goethe-Universität, Frankfurt am Main (2001)
Hochschulschrift - Doktorarbeit
Reinhart, C.: Charakterisierung, Solubilisierung und Reinigung eines ß2-adrenergen Rezeptors nach heterologer Produktion in der methylotrophen Hefe Pichia pastoris. Dissertation, 149 S., Fachbereich Chemische und Pharmazeutische Wissenschaften, Johann Wolfgang Goethe-Universität, Frankfurt am Main (2001)
Hochschulschrift - Doktorarbeit
Szmolenszky, A.: Development and Characterization of Antibodies and Antibody Fragments Against the Human β2-Adrenergic Receptor. Dissertation, 177 S., Fachbereich Chemische und Pharmazeutische Wissenschaften, Johann Wolfgang Goethe-Universität Frankfurt, Frankfurt am Main (2001)

Hochschulschrift - Diplom (5)

2001
Hochschulschrift - Diplom
Meesters, C.: Identifizierung der Extramembrandomänen im Na+/H+-Antiporter NhaA von E. coli durch Markierung mit Goldpartikel und Antikörperfragmenten an 2D-Kristallen. Diplom, 73 S., Institut für Allgemeine Botanik, Johannes Gutenberg-Universität, Mainz (2001)
Hochschulschrift - Diplom
Hanekop, N.: Phospholipidbindung im Cytochrom bc1-Komplex. Diplom, 73 S., Fachbereich Chemische und Pharmazeutische Wissenschaften, Johann Wolfgang Goethe-Universität Frankfurt, Frankfurt am Main (2001)
Hochschulschrift - Diplom
Eschenröder, N.: Selection and production of membrane protein specific scFv fragments using phage display library. Diplom, 85 S., Fachbereich Chemische und Pharmazeutische Wissenschaften, Johann Wolfgang Goethe-Universität Frankfurt, Frankfurt am Main (2001)
Hochschulschrift - Diplom
Hofacker, M. M.: Gezielter Austausch von Aminosäuren im Bereich des distalen Häms der Fumarat-Reduktase von Wolinella succinogenes. Diplom, 76 S., Fachbereich Chemische und Pharmazeutische Wissenschaften, Johann Wolfgang Goethe-Universität Frankfurt, Frankfurt am Main (2001)
Hochschulschrift - Diplom
Sauer, U. S.: Gezielter Ausstausch von Aminosäuren im Bereich des proximalen Häms der Fumarate-Reduktase von Wolinella succinogenes. Diplom, 100 S., Fachbereich chemische und pharmazeutische Wissenschaften, Johann Wolfgang Goethe-Universität, Frankfurt am Main (2001)
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